retroplasmide
Elemento mobile capace di integrarsi nel genoma di una cellula svolgendo la stessa funzione di un provirus nel ciclo vitale di un retrovirus. Il plasmide Mauriceville, dotato di un genoma a RNA o a DNA, a seconda della fase del suo ciclo, può essere definito un retroplasmide, in cui il plasmide a DNA svolge la stessa funzione di un provirus. Il genoma del virus del mosaico del cavolfiore (CaMV) è un DNA circolare a doppia elica che si replica come elemento extra-cromosomico senza mai integrarsi nel DNA cromosomico. La trascrizione del genoma virale inizia a livello di una particolare regione regolatrice che, analogamente all’LTR (Long terminal repeat) retrovirale, è costituita da un promotore della RNA polimerasi II, posto subito a monte di un segnale di poliadenilazione. La trascrizione del genoma genera un trascritto ridondante in posizione terminale, con lunghezza leggermente maggiore di quella definitiva. Questo RNA genomico è poi convertito in cDNA da una trascrittasi inversa codificata da CaMV, utilizzando tRNA come primer. Questo è uno schema di replicazione molto simile a quello usato dai retrovirus, con la differenza che l’integrazione del DNA del retrovirus nel cromosoma ospite genera un provirus a DNA lineare con una copia della regione regolatrice a ogni estremità terminale, e che la trascrizione, a partire dal promotore del provirus a monte fino al segnale distale di poliadenilazione, genera l’RNA genomico con la zona ridondante nella parte terminale. Questa filogenesi può essere estesa ai cromosomi cellulari. La telomerasi, l’enzima che replica le estremità degli attuali cromosomi, è una ribonucleoproteina la cui componente di RNA serve da stampo interno per l’aggiunta delle sequenze da parte della subunità proteica. Il meccanismo d’azione della telomerasi è analogo a quello della trascrittasi inversa del plasmide Mauriceville che addiziona il tratto finale ripetuto CCACCA al marcatore genomico tRNA-simile; in particolare, sia la trascrittasi inversa del retroplasmide sia la telomerasi possono iniziare a livello di una sequenza CCA interna, usando un primer di DNA. (*)
→ RNA